Kolmen kampuksen urheiluopisto tukee urheilijoiden, valmentajien ja lajikumppaneiden toimintaa kahden eri säätiön kautta jaettavilla apurahoilla. Näiden apurahojen tarkoitus on edistää urheilua, valmennusta ja liikuntakasvatusta sekä tukea kehittymistä niin yksilö- kuin joukkuetasolla.

Urheiluopistosäätiö jakaa pitkät perinteet omaavia apurahoja, joita myönnetään muun muassa liikuntatieteelliseen tutkimukseen sekä työskentelyyn liittyviin kuluihin. Säätiö tukee tutkimushankkeita, väitöskirjoja ja liikuntalääketieteellistä tutkimusta, ja tarjoaa sekä monivuotisia että yksivuotisia apurahoja.

Kisakalliosäätiö on aloittanut apurahojen jakamisen vuonna 2026. Apurahat on suunnattu yhteistyölajeille ja urheilijoille, ja niitä myönnetään kolmessa eri kategoriassa tukemaan valmennusta, joukkueurheilua ja yksilöiden leirityksiä.